הרב הכריע על פי הכף החיים (קמג ס"ק לד) שכותב כך. אבל כבר הרחיב מרן היחו"ד (ח"ו נו) שמותר לעלות ולברך על ספר תורה תימני, כיוון שיש להם מסורת איש מפי איש. אחרת אשכנזי לא יעלה לספר תורה תימני ולהיפך. וכתב הגר"ש קלוגר (קנאת סופרי קכא) שאדם שנוהג כך צריך לתת לו מלקות ולרדוף אותו. לשון נוראה ביותר!  שאחרת יש בזה הוצאת לעז על קהילות קודש מדורי דורות, וכפי שהרחיבו בזה רבים מן האחרונים (מנח"י ב יב, צי"א יד ג, יבי"א ח יו"ד כה). כפי שהעידו על מרן הסטייפלר שעלה לתורה גם בספר תורה שכתוב בכתב האר"י ז"ל, אף שהאות צ' הפוכה. ואפילו בספר תורה שחלק מן הצ' ישרים וחלק הפוכים פסק הישמח משה (השיב משה יו"ד נא) שניתן לעלות אליו, כי אלו ואלו דברי אלקים חיים.

רק בפרשת זכור היו שהקפידו לקרוא דווקא על פי מנהגם בקריאה ובכתיבה.